igUpload エクスプローラーで選択したファイルのフルパスを取得することはできますか？

できません。

igUploadは標準の<input type=”file”>を使用しているのですが、ブラウザ側が、セキュリティ仕様によりクライアント側の情報操作/取得を制限しているためです。