XamDataChart の数値 Y 軸の表示を 3 桁のカンマ区切りにしたい場合は、NumericYAxis の Label プロパティに N0 の書式を指定してください。
<ig:XamDataChart ...>
<ig:XamDataChart.Axes>
... (中略) ...
<ig:NumericYAxis x:Name="yAxis" ... Label="{}{0:N0}"/>
</ig:XamDataChart.Axes>
... (中略) ...
</ig:XamDataChart>
実行結果
